Come illustrato nella figura seguente (tratta da una presentazione del Centro di Competenza AIPA sul protocollo informatico), vi sono almeno quattro testi normativi fondamentali sul protocollo informatico:

1. Il DPR 445/ 2000, "Testo Unico delle disposizioni legislative e regolamentari in materia di documentazione amministrativa". Attenzione, il testo ha subito varie modifiche dalla sua uscita, è necessario essere sicuri di avere la versione più aggiornata. 
2. Il DPCM 31/10/2000, regole tecniche per il protocollo informatico
3. La circolare AIPA 28/2001, regole tecniche sull'interoperabilità del protocollo informatico ("Standard, modalità di trasmissione, formato e definizioni dei tipi di informazioni minime ed accessorie comunemente scambiate tra le pubbliche amministrazioni e associate ai documenti protocollati") 
4. La Delibera AIPA 42/2001 sulla conservazione dei documenti non originali in formato elettronico, e la delibera AIPA 51/2000 sulla conservazione dei documenti elettronici originali. Da ricordare che i sistemi operativi utilizzati per le applicazioni sul protocollo informatico devono rispondere ai requisiti di sicurezza previsti dalla circolare AIPA 31/2001. 

Norme di indirizzo sono contenuti nelle seguenti direttive:

1. Direttiva del Presidente del Consiglio dei Ministri sulla gestione informatica dei flussi documentali nelle pubbliche amministrazioni del 28 ottobre 1999;
2. Direttiva del Ministro per l’innovazione e le tecnologie su “Linee guida in materia di digitalizzazione dell’amministrazione” emanata il 21 dicembre 2001
3. Direttiva del Ministro per l’innovazione e le tecnologie sulla trasparenza dell’azione amministrativa e gestione dei flussi documentali emanata il 9 dicembre 2002 
4. Direttiva del Ministro per l’innovazione e le tecnologie su “Linee guida in materia di digitalizzazione dell’amministrazione” emanata il 20 dicembre 2002

Utili guide all'attuazione dei sistemi (fattibilità, analisi, e progettazione), sono contenuti nei seguenti documenti redatti dal centro di competenza AIPA:

1. Linee guida per l’adozione del protocollo informatico e per il trattamento informatico dei procedimenti amministrativi con l'allegata check list per la verifica e valutazione dei sistemi di protocollo informatico. 
2. Il documento del Gruppo di lavoro sul Protocollo informatico: “L'interoperabilità dei sistemi di protocollo informatico in ambiente distribuito"
3. Studio di prefattibilità sul Sistema di gestione dei flussi di documenti (GEDOC 1)
4. Linee guida alla realizzazione dei sistemi di protocollo informatico e gestione dei flussi documentali nelle pubbliche amministrazioni (GEDOC 2)